在本季《超级飞侠》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。 而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
经历了第一季和第二季的种种状况，莱德带领的汪汪队越战越勇！莱德队长接到任务，新一季的挑战马上拉开帷幕！帮小精灵实现愿望，去北极搭救北极熊宝宝，帮助外星人修理太空飞船，汪汪队总能出色完成任务！更值得期待的是，在一次救援行动中，一只大耳朵狗狗Tracker机智英勇地帮助汪汪队完成任务，而受邀成为汪汪队新成员！
夏季庆典结束后，打烊了的学生们有一个E班的学生来到他们身边。第二天，在开班仪式上的讲台上竹林突然做出了与E组一起度过的4个多月如同地狱的样子。在知道竹林超过E组加入A组的E组学生试图说服他……。
