故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。 在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了， 小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了! 在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
经历了第一季和第二季的种种状况，莱德带领的汪汪队越战越勇！莱德队长接到任务，新一季的挑战马上拉开帷幕！帮小精灵实现愿望，去北极搭救北极熊宝宝，帮助外星人修理太空飞船，汪汪队总能出色完成任务！更值得期待的是，在一次救援行动中，一只大耳朵狗狗Tracker机智英勇地帮助汪汪队完成任务，而受邀成为汪汪队新成员！
