世王集齐了世言铠,恢复了往昔的强大力量,他企图违背自然规律,加速进化进程,让“毁灭之力”席卷世界。灵犀令牌被毁,十阶冲破封印在即,黑暗再次降临。为了拯救人类世界和叶罗丽仙境,叶罗丽战士们不畏艰险,勇敢回到了自然之力充沛的远古仙境,向当时正处于力量强盛期的仙子们寻求帮助,与此同时,灵犀阁也开始行动,设法解救被薇夫人控制的伙伴们,并牵制住十阶。面对强大的灾难,人类并没有被打倒,而是选择凭借智慧和勇气,齐心协力应对挑战。人类与仙子们团结起来,一场关于爱与守护的终极决战即将打响!
為迎接機動戰士鋼彈SEED十周年的2012年,官方於2011年8月26日啟動「HD Remaster Project(高畫質再製企劃)」,畫面尺寸比將從原先的4:3升級為16:9寬螢幕,線性PCM音源化,部分音樂採用混音版,局部畫面的替換和修正,各特效與背景的處理變更,並整合特別版三部作以及「DESTINY」的賽璐珞片,再編輯為全48話,收錄至Blu-ray共四卷BOX販售。相較於過去其他鋼彈作品的Remaster僅是單純的高畫質化,本作有著更全面的提升。「機動戰士鋼彈SEED HD」於2011年12月23日起在BandaiChannel針對日本國內進行限定放送,TV方面則於2012年1月1日起在日本BS11播映。gundam.info同時提供附有簡體中文(已不再提供)、繁體中文、英文和韓文字幕影片的網路配信。愛奇藝將本作命名為「機動戰士高達SEED HD Remaster」於2011年12月23日11時起播出。