时为公元二二〇五年。 是以改变历史为目的的“历史修正主义者”开始对过去实施攻击的时代。 被赋予了守护历史这一使命的“审神者”,由他们所唤起的最强付丧神“刀剑男士”。 这是,他们以“某个本丸”为舞台,一心一意、开朗明快地生活的“花丸”物语——
夏季庆典结束后,打烊了的学生们有一个E班的学生来到他们身边。第二天,在开班仪式上的讲台上竹林突然做出了与E组一起度过的4个多月如同地狱的样子。在知道竹林超过E组加入A组的E组学生试图说服他……。