《太乙仙魔录》为明代背景下的仙侠故事，讲述的是玄魔两道之间已经持续了数千年的纷争。因两道的决战接连两次发生在昆仑山，故又被称为昆仑之战。传说第一次和第二次昆仑之战玄门都在南极帝君和紫薇女帝的帮助下击败魔道，为中元界带来和平。我们的男女主角——小皇帝朱允炆和玄门弟子冷霜凝，正是南极帝君和紫薇女帝的转世。此番玄门内部生变，魔道众人也打算趁虚而入，第三次昆仑大战迫在眉睫。而这一次的大战的走向因为一股神秘力量的介入而显得更加阴云密布，中元界就此陷入危机。
夏季庆典结束后，打烊了的学生们有一个E班的学生来到他们身边。第二天，在开班仪式上的讲台上竹林突然做出了与E组一起度过的4个多月如同地狱的样子。在知道竹林超过E组加入A组的E组学生试图说服他……。
