十二年前，大澳一对青年男女风与妹私奔失败，妹只身迁往香港，从此二人一水隔天涯。十二年后妹为找寻昔日宁静的乡土，由香港迁回大澳居住，更与旧恋人风重拾旧欢。但不同的生活痕迹，使他们的感情受到考验。对从大陆逃港的青年坤﹝刘青云饰﹞来说，香港祇是其踏脚石。为了前往巴拉圭，他冒着被警方追缉和被黑社会追杀的危险，潜逃香港，并匿藏大澳。究竟他能否如愿以偿？风与妹感情又能否携手终老
花满楼为陆小凤好友，出身于医学世家，自幼因病盲目，但有着高超的武功，和异常敏锐的听觉与嗅觉。 绣花大盗屡犯奇案，京城为之轰动。陆小凤被友所激追查此案，花满楼助之，二人终查出绣花大盗乃名捕金九龄，满楼与之打斗时檀香剑客杀出，刺死金九龄灭口。 西方圣教入侵中土武林，派卧底到中原各大门派，陆小凤、花满楼、西门吹雪察觉，并助各门派铲除奸细，三人更组织中原众高手一同深入楼兰。期间，小凤对薛冰的痴缠不胜其烦，却爱上风尘女子晶晶；满楼亦暗恋晶晶，但知其心仪小凤后黯然退出。晶晶本为圣教圣女，但她因恋小凤而不欲争教主之位。冰祖母薛夫人为救小凤而亡，使冰对凤心死。 中原另有一神秘隐形人组织与圣教暗中较劲，金九龄与檀香剑客均为其旗下杀手。隐形组织偷去圣教圣物罗剎令，使玉罗刹教主地位不保，并引起教中内斗。小凤等几经艰苦到神秘岛探查，得知隐形人组织首领为流云居士，其武功高深莫测，小凤与其契女牛肉汤施假婚之计才得以脱身。 某夜忽有女子潜入花家，被满楼察觉，女子自言名为慕容双，被歹人追杀，满楼相救。双深得花母好感，满楼也渐渐对双心生爱意。 吹雪妻子孙秀清被檀香剑客所伤，不治身亡。吹雪在小凤与檀香剑客打斗之时冲出，杀死檀香剑客报仇。岂料檀香剑客竟是满楼兄长花月楼，满楼悲痛欲绝。 冰离开花家独自飘摇，后偶遇流云，流云对冰悉心照顾，使冰感动，以身相许。 圣教长老日月二圣造反，欲废玉罗刹教主之位。晶晶为助玉罗刹平叛，勉为其难继任教主。小凤密探西方教坛，发现晶晶身份，大受打击，离晶晶而去，晶晶伤心不已，玉罗刹始道出她乃晶晶生母。 小凤等向中原武林公开流云的身份，流云约小凤公开决斗。小凤处下风之时，牛肉汤舍身相救，比武因而延期。西方圣教与隐形组织的争斗愈演愈厉，玉罗刹率众血洗珍宝岛；流云继而派人攻陷罗刹洞。玉罗刹约流云有所了结，原来二人曾有一段情，流云为晶晶生父。玉罗刹落毒欲同归于尽，岂料流云逃过大难，玉罗刹身死。 小凤与流云决战之期，全武林人士在旁观战。小凤施展绝技“凤舞九天”，将流云打落悬崖，流云经海底暗潜回珍宝岛。当夜雷雨交加，满楼与双双洞房花烛。暴风雨中海啸爆发，珍宝岛陆沉，流云、冰、牛肉汤均葬身大海。 小凤往楼兰寻晶晶，见其在神坛祈福，教众俯首，自知二人已无可能，返回中原继续其浪子生活。
明朝末年，武当派数位高手相继遇害。时隔多年，凶手仍然是个谜。当昔日遗孤——当俗家弟子耿玉京已长成翩翩少年时，与前来比武的东方亮不打不相识，成为了无话不谈的挚友。倏忽间，风云再起，先是泰昌帝服用武当红丸后暴毙，后是新任武当掌门又对耿玉京步步相逼。无奈之下，耿玉京离开了武当山，在“独行大盗”郑铁岗和其孙女郑巧儿的帮助下，秘密追查当年父母遇害的真相……在追查事情的过程中，他又先后遇到了少林僧人慧可、断魂谷谷主卢象升、昆仑西门燕等武林人士，最后还与辽东的努尔哈赤成为了忘年之交。当调查逐渐有了指向，昔年隐藏的真相逐渐显露端倪时，耿玉京终于发现了努尔哈赤鲸吞中原的野心，而自己的父母当初便是因此而被害。带着国仇和家恨，耿玉京、东方亮一行回到了武当，自此埋藏多年的谜案终于揭晓，内奸也受到了应有的惩罚。
香港飞行服务队(GFS)二级空勤主任高可风(郑伊健饰)和一级机师叶青云(林保怡饰)一个负责拯救一个负责驾驶，合作默契。可风的女友康友岚（佘诗曼饰）三年前因车祸昏迷，至今未醒。可风每天都去医院探望，终于奇迹发生，友岚苏醒过来，但是失去所有记忆。在可风的热情下重新接受他。叶青云与妻子离婚多年，独自带着可爱的儿子Jacket生活，感觉不到房东兼同事小娟对他的爱意。GFS新一届的学员诞生，风、云分别担任施楚淇（钟嘉欣饰）与见习机师蒋加诺（黎诺懿饰）的导师，淇自小被父亲抛弃，在孤儿院长大，自卑感严重；而加诺是富家少爷，但家庭突遭巨变。面对种种压力，他们能否顺利毕业？而友岚感觉被热心助人的可风冷落，感情渐渐偏向叶青云，突然的恢复记忆让她忆起了当日车祸的真相。他们的感情线将何去何从？
