神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
和我们一起，继续成长的物语。 阿良良木历的物语结束了。 以地狱般的春假为开端， 历经各种因缘际会， 阿良良木历高中生活最后的一年结束了 ——原本是这么想的。 但就在毕业典礼结束的第二天早晨，发生了意想不到的事态。 历，迷失到了镜中的世界。 这是，既非高中生也非大学生， 处在这种时期的阿良良木历所体验的， 终结之继续的物语。 高中毕业典礼的第二天早晨。 准备洗脸而面向洗脸台镜子的历， 陷入了被映在那里的自己盯着看的感觉。 他不由得用手触碰镜子， 于是手指尖就这样陷了进去……。 回过神来，历已经身处一切都反转过来的世界中。
