秦烈和同伴们继续在秘境神葬场中进行着残酷的试炼。神葬场中危机四伏，秦烈从巫虫的控制中救下洛尘之后，却发现只有打败操控巫虫的黑巫教教主，才能真正拯救洛尘的性命。而在他们前进的道路上，还有野蛮的夷族和能聚引天雷的雷兽在等着他们去挑战。在寒冰禁地，冰灵也睁开双眼，注视着秘境中发生的一切……
為迎接機動戰士鋼彈SEED十周年的2012年，官方於2011年8月26日啟動「HD Remaster Project（高畫質再製企劃）」，畫面尺寸比將從原先的4：3升級為16：9寬螢幕，線性PCM音源化，部分音樂採用混音版，局部畫面的替換和修正，各特效與背景的處理變更，並整合特別版三部作以及「DESTINY」的賽璐珞片，再編輯為全48話，收錄至Blu-ray共四卷BOX販售。相較於過去其他鋼彈作品的Remaster僅是單純的高畫質化，本作有著更全面的提升。「機動戰士鋼彈SEED HD」於2011年12月23日起在BandaiChannel針對日本國內進行限定放送，TV方面則於2012年1月1日起在日本BS11播映。gundam.info同時提供附有簡體中文(已不再提供)、繁體中文、英文和韓文字幕影片的網路配信。愛奇藝將本作命名為「機動戰士高達SEED HD Remaster」於2011年12月23日11時起播出。
